Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXL1

Sec24d, Sec24-related gene family, member D (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24dQ6NXL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Sec24dQ6NXL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sec24dQ6NXL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sec24dQ6NXL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sec24dQ6NXL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Sec24dQ6NXL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sec24dQ6NXL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Sec24dQ6NXL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Sec24dQ6NXL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sec24dQ6NXL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sec24dQ6NXL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sec24dQ6NXL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sec24dQ6NXL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sec24dQ6NXL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sec24dQ6NXL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sec24dQ6NXL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Sec24dQ6NXL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sec24dQ6NXL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sec24dQ6NXL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sec24dQ6NXL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sec24dQ6NXL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sec24dQ6NXL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sec24dQ6NXL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sec24dQ6NXL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sec24dQ6NXL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sec24dQ6NXL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sec24dQ6NXL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sec24dQ6NXL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sec24dQ6NXL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sec24dQ6NXL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sec24dQ6NXL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sec24dQ6NXL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sec24dQ6NXL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sec24dQ6NXL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sec24dQ6NXL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sec24dQ6NXL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sec24dQ6NXL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sec24dQ6NXL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sec24dQ6NXL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sec24dQ6NXL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sec24dQ6NXL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sec24dQ6NXL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Sec24dQ6NXL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sec24dQ6NXL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sec24dQ6NXL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sec24dQ6NXL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sec24dQ6NXL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sec24dQ6NXL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sec24dQ6NXL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sec24dQ6NXL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sec24dQ6NXL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sec24dQ6NXL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sec24dQ6NXL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sec24dQ6NXL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sec24dQ6NXL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sec24dQ6NXL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sec24dQ6NXL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sec24dQ6NXL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sec24dQ6NXL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sec24dQ6NXL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec24dQ6NXL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sec24dQ6NXL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sec24dQ6NXL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sec24dQ6NXL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec24dQ6NXL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sec24dQ6NXL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sec24dQ6NXL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sec24dQ6NXL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sec24dQ6NXL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sec24dQ6NXL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sec24dQ6NXL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sec24dQ6NXL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sec24dQ6NXL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sec24dQ6NXL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sec24dQ6NXL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sec24dQ6NXL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sec24dQ6NXL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sec24dQ6NXL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sec24dQ6NXL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sec24dQ6NXL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sec24dQ6NXL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sec24dQ6NXL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sec24dQ6NXL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sec24dQ6NXL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sec24dQ6NXL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sec24dQ6NXL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sec24dQ6NXL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sec24dQ6NXL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms