Protein–RNA interactions for Protein: Q62056

Psg17, MCG130054, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg17Q62056 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Psg17Q62056 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psg17Q62056 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psg17Q62056 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psg17Q62056 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psg17Q62056 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psg17Q62056 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Psg17Q62056 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Psg17Q62056 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Psg17Q62056 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psg17Q62056 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psg17Q62056 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Psg17Q62056 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Psg17Q62056 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psg17Q62056 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psg17Q62056 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psg17Q62056 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Psg17Q62056 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psg17Q62056 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psg17Q62056 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psg17Q62056 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psg17Q62056 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psg17Q62056 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psg17Q62056 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psg17Q62056 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psg17Q62056 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psg17Q62056 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psg17Q62056 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Psg17Q62056 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psg17Q62056 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psg17Q62056 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psg17Q62056 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psg17Q62056 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psg17Q62056 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psg17Q62056 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Psg17Q62056 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psg17Q62056 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psg17Q62056 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psg17Q62056 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psg17Q62056 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psg17Q62056 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psg17Q62056 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psg17Q62056 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psg17Q62056 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psg17Q62056 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psg17Q62056 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psg17Q62056 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psg17Q62056 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psg17Q62056 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psg17Q62056 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psg17Q62056 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psg17Q62056 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psg17Q62056 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psg17Q62056 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psg17Q62056 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psg17Q62056 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psg17Q62056 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psg17Q62056 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psg17Q62056 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psg17Q62056 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psg17Q62056 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psg17Q62056 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psg17Q62056 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psg17Q62056 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psg17Q62056 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psg17Q62056 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psg17Q62056 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psg17Q62056 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psg17Q62056 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psg17Q62056 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psg17Q62056 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psg17Q62056 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Psg17Q62056 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psg17Q62056 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psg17Q62056 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psg17Q62056 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psg17Q62056 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psg17Q62056 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psg17Q62056 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psg17Q62056 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psg17Q62056 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psg17Q62056 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psg17Q62056 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psg17Q62056 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psg17Q62056 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psg17Q62056 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psg17Q62056 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psg17Q62056 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psg17Q62056 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psg17Q62056 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms