Protein–RNA interactions for Protein: Q61979

Nnat, Neuronatin, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NnatQ61979 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NnatQ61979 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NnatQ61979 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NnatQ61979 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NnatQ61979 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NnatQ61979 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NnatQ61979 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NnatQ61979 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NnatQ61979 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NnatQ61979 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NnatQ61979 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NnatQ61979 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NnatQ61979 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NnatQ61979 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NnatQ61979 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NnatQ61979 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NnatQ61979 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NnatQ61979 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NnatQ61979 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NnatQ61979 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NnatQ61979 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NnatQ61979 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NnatQ61979 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NnatQ61979 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NnatQ61979 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NnatQ61979 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NnatQ61979 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NnatQ61979 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NnatQ61979 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NnatQ61979 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NnatQ61979 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NnatQ61979 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NnatQ61979 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NnatQ61979 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NnatQ61979 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NnatQ61979 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NnatQ61979 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NnatQ61979 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NnatQ61979 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NnatQ61979 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NnatQ61979 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NnatQ61979 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NnatQ61979 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NnatQ61979 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NnatQ61979 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NnatQ61979 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NnatQ61979 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NnatQ61979 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NnatQ61979 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NnatQ61979 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NnatQ61979 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NnatQ61979 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NnatQ61979 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NnatQ61979 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NnatQ61979 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NnatQ61979 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NnatQ61979 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NnatQ61979 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NnatQ61979 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NnatQ61979 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NnatQ61979 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NnatQ61979 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NnatQ61979 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NnatQ61979 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NnatQ61979 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NnatQ61979 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NnatQ61979 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NnatQ61979 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NnatQ61979 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NnatQ61979 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NnatQ61979 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NnatQ61979 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NnatQ61979 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NnatQ61979 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NnatQ61979 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NnatQ61979 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NnatQ61979 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NnatQ61979 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NnatQ61979 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NnatQ61979 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NnatQ61979 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NnatQ61979 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NnatQ61979 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NnatQ61979 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NnatQ61979 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NnatQ61979 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NnatQ61979 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NnatQ61979 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NnatQ61979 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NnatQ61979 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NnatQ61979 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NnatQ61979 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NnatQ61979 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NnatQ61979 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NnatQ61979 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NnatQ61979 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NnatQ61979 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NnatQ61979 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NnatQ61979 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NnatQ61979 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms