Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Trp53i11Q4QQM4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trp53i11Q4QQM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trp53i11Q4QQM4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trp53i11Q4QQM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Trp53i11Q4QQM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trp53i11Q4QQM4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Trp53i11Q4QQM4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Trp53i11Q4QQM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trp53i11Q4QQM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trp53i11Q4QQM4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trp53i11Q4QQM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Trp53i11Q4QQM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trp53i11Q4QQM4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trp53i11Q4QQM4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trp53i11Q4QQM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trp53i11Q4QQM4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trp53i11Q4QQM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trp53i11Q4QQM4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trp53i11Q4QQM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trp53i11Q4QQM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trp53i11Q4QQM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trp53i11Q4QQM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trp53i11Q4QQM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trp53i11Q4QQM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trp53i11Q4QQM4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trp53i11Q4QQM4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trp53i11Q4QQM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trp53i11Q4QQM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trp53i11Q4QQM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trp53i11Q4QQM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trp53i11Q4QQM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trp53i11Q4QQM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trp53i11Q4QQM4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trp53i11Q4QQM4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trp53i11Q4QQM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trp53i11Q4QQM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trp53i11Q4QQM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trp53i11Q4QQM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trp53i11Q4QQM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trp53i11Q4QQM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Trp53i11Q4QQM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trp53i11Q4QQM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trp53i11Q4QQM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trp53i11Q4QQM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trp53i11Q4QQM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trp53i11Q4QQM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trp53i11Q4QQM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trp53i11Q4QQM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trp53i11Q4QQM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trp53i11Q4QQM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trp53i11Q4QQM4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trp53i11Q4QQM4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trp53i11Q4QQM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trp53i11Q4QQM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trp53i11Q4QQM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trp53i11Q4QQM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trp53i11Q4QQM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trp53i11Q4QQM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trp53i11Q4QQM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trp53i11Q4QQM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trp53i11Q4QQM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trp53i11Q4QQM4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trp53i11Q4QQM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trp53i11Q4QQM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trp53i11Q4QQM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trp53i11Q4QQM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trp53i11Q4QQM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trp53i11Q4QQM4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trp53i11Q4QQM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trp53i11Q4QQM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trp53i11Q4QQM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trp53i11Q4QQM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trp53i11Q4QQM4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53i11Q4QQM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trp53i11Q4QQM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trp53i11Q4QQM4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trp53i11Q4QQM4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trp53i11Q4QQM4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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