Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Mmp25Q3U435 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Mmp25Q3U435 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Mmp25Q3U435 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mmp25Q3U435 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Mmp25Q3U435 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mmp25Q3U435 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Mmp25Q3U435 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Mmp25Q3U435 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Mmp25Q3U435 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mmp25Q3U435 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mmp25Q3U435 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mmp25Q3U435 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mmp25Q3U435 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Mmp25Q3U435 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Mmp25Q3U435 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Mmp25Q3U435 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mmp25Q3U435 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mmp25Q3U435 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mmp25Q3U435 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mmp25Q3U435 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mmp25Q3U435 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mmp25Q3U435 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmp25Q3U435 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mmp25Q3U435 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mmp25Q3U435 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmp25Q3U435 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mmp25Q3U435 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp25Q3U435 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmp25Q3U435 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mmp25Q3U435 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mmp25Q3U435 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mmp25Q3U435 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp25Q3U435 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mmp25Q3U435 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mmp25Q3U435 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mmp25Q3U435 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mmp25Q3U435 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp25Q3U435 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp25Q3U435 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mmp25Q3U435 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp25Q3U435 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp25Q3U435 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp25Q3U435 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp25Q3U435 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp25Q3U435 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp25Q3U435 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp25Q3U435 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp25Q3U435 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp25Q3U435 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp25Q3U435 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mmp25Q3U435 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Mmp25Q3U435 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mmp25Q3U435 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mmp25Q3U435 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mmp25Q3U435 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mmp25Q3U435 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mmp25Q3U435 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mmp25Q3U435 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mmp25Q3U435 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mmp25Q3U435 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp25Q3U435 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp25Q3U435 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mmp25Q3U435 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mmp25Q3U435 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmp25Q3U435 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmp25Q3U435 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mmp25Q3U435 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Mmp25Q3U435 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp25Q3U435 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmp25Q3U435 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mmp25Q3U435 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmp25Q3U435 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mmp25Q3U435 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Mmp25Q3U435 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mmp25Q3U435 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mmp25Q3U435 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mmp25Q3U435 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mmp25Q3U435 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mmp25Q3U435 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mmp25Q3U435 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Mmp25Q3U435 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mmp25Q3U435 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mmp25Q3U435 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mmp25Q3U435 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mmp25Q3U435 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp25Q3U435 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mmp25Q3U435 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mmp25Q3U435 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mmp25Q3U435 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms