Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZM9

Alg11, GDP-Man:Man(3)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,2-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg11Q3TZM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Alg11Q3TZM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Alg11Q3TZM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Alg11Q3TZM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Alg11Q3TZM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Alg11Q3TZM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alg11Q3TZM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Alg11Q3TZM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Alg11Q3TZM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Alg11Q3TZM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Alg11Q3TZM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Alg11Q3TZM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Alg11Q3TZM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alg11Q3TZM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg11Q3TZM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg11Q3TZM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alg11Q3TZM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alg11Q3TZM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alg11Q3TZM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Alg11Q3TZM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Alg11Q3TZM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Alg11Q3TZM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Alg11Q3TZM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Alg11Q3TZM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alg11Q3TZM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alg11Q3TZM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alg11Q3TZM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alg11Q3TZM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Alg11Q3TZM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Alg11Q3TZM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alg11Q3TZM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alg11Q3TZM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alg11Q3TZM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alg11Q3TZM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Alg11Q3TZM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Alg11Q3TZM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg11Q3TZM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Alg11Q3TZM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg11Q3TZM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alg11Q3TZM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alg11Q3TZM9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alg11Q3TZM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alg11Q3TZM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg11Q3TZM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Alg11Q3TZM9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Alg11Q3TZM9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Alg11Q3TZM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Alg11Q3TZM9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alg11Q3TZM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alg11Q3TZM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Alg11Q3TZM9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Alg11Q3TZM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Alg11Q3TZM9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg11Q3TZM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Alg11Q3TZM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Alg11Q3TZM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Alg11Q3TZM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Alg11Q3TZM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Alg11Q3TZM9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Alg11Q3TZM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Alg11Q3TZM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alg11Q3TZM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Alg11Q3TZM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Alg11Q3TZM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Alg11Q3TZM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alg11Q3TZM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alg11Q3TZM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alg11Q3TZM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Alg11Q3TZM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alg11Q3TZM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alg11Q3TZM9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alg11Q3TZM9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alg11Q3TZM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Alg11Q3TZM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alg11Q3TZM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alg11Q3TZM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alg11Q3TZM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alg11Q3TZM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alg11Q3TZM9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alg11Q3TZM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alg11Q3TZM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Alg11Q3TZM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Alg11Q3TZM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alg11Q3TZM9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alg11Q3TZM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alg11Q3TZM9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alg11Q3TZM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alg11Q3TZM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alg11Q3TZM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Alg11Q3TZM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alg11Q3TZM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alg11Q3TZM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alg11Q3TZM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Alg11Q3TZM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alg11Q3TZM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alg11Q3TZM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alg11Q3TZM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alg11Q3TZM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alg11Q3TZM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alg11Q3TZM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms