Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Shroom4Q1W617 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Shroom4Q1W617 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Shroom4Q1W617 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Shroom4Q1W617 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Shroom4Q1W617 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
Shroom4Q1W617 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.07■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Shroom4Q1W617 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Shroom4Q1W617 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Shroom4Q1W617 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.88■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Shroom4Q1W617 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Shroom4Q1W617 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Shroom4Q1W617 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Shroom4Q1W617 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Shroom4Q1W617 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Shroom4Q1W617 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Shroom4Q1W617 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Shroom4Q1W617 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Shroom4Q1W617 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Shroom4Q1W617 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Shroom4Q1W617 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Shroom4Q1W617 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Shroom4Q1W617 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Shroom4Q1W617 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Shroom4Q1W617 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Shroom4Q1W617 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Shroom4Q1W617 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
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Shroom4Q1W617 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
Shroom4Q1W617 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms