Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Cd300lgQ1ERP8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cd300lgQ1ERP8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cd300lgQ1ERP8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cd300lgQ1ERP8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cd300lgQ1ERP8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cd300lgQ1ERP8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cd300lgQ1ERP8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Cd300lgQ1ERP8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cd300lgQ1ERP8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cd300lgQ1ERP8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cd300lgQ1ERP8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cd300lgQ1ERP8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Cd300lgQ1ERP8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cd300lgQ1ERP8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Cd300lgQ1ERP8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cd300lgQ1ERP8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cd300lgQ1ERP8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cd300lgQ1ERP8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cd300lgQ1ERP8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cd300lgQ1ERP8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cd300lgQ1ERP8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Cd300lgQ1ERP8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cd300lgQ1ERP8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cd300lgQ1ERP8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cd300lgQ1ERP8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Cd300lgQ1ERP8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cd300lgQ1ERP8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cd300lgQ1ERP8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cd300lgQ1ERP8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cd300lgQ1ERP8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cd300lgQ1ERP8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cd300lgQ1ERP8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cd300lgQ1ERP8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cd300lgQ1ERP8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cd300lgQ1ERP8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cd300lgQ1ERP8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cd300lgQ1ERP8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cd300lgQ1ERP8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cd300lgQ1ERP8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cd300lgQ1ERP8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cd300lgQ1ERP8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cd300lgQ1ERP8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cd300lgQ1ERP8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cd300lgQ1ERP8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cd300lgQ1ERP8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cd300lgQ1ERP8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cd300lgQ1ERP8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cd300lgQ1ERP8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cd300lgQ1ERP8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cd300lgQ1ERP8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cd300lgQ1ERP8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cd300lgQ1ERP8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cd300lgQ1ERP8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cd300lgQ1ERP8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cd300lgQ1ERP8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cd300lgQ1ERP8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cd300lgQ1ERP8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd300lgQ1ERP8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd300lgQ1ERP8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd300lgQ1ERP8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd300lgQ1ERP8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd300lgQ1ERP8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd300lgQ1ERP8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cd300lgQ1ERP8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cd300lgQ1ERP8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd300lgQ1ERP8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd300lgQ1ERP8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd300lgQ1ERP8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cd300lgQ1ERP8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd300lgQ1ERP8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cd300lgQ1ERP8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cd300lgQ1ERP8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cd300lgQ1ERP8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cd300lgQ1ERP8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd300lgQ1ERP8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd300lgQ1ERP8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd300lgQ1ERP8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cd300lgQ1ERP8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cd300lgQ1ERP8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cd300lgQ1ERP8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cd300lgQ1ERP8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cd300lgQ1ERP8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cd300lgQ1ERP8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd300lgQ1ERP8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd300lgQ1ERP8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
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