Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CluQ06890 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CluQ06890 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CluQ06890 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CluQ06890 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CluQ06890 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CluQ06890 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CluQ06890 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CluQ06890 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CluQ06890 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CluQ06890 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CluQ06890 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CluQ06890 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CluQ06890 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CluQ06890 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CluQ06890 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CluQ06890 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluQ06890 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CluQ06890 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CluQ06890 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CluQ06890 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluQ06890 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluQ06890 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CluQ06890 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluQ06890 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluQ06890 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluQ06890 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CluQ06890 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CluQ06890 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CluQ06890 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CluQ06890 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluQ06890 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluQ06890 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluQ06890 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluQ06890 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CluQ06890 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluQ06890 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluQ06890 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CluQ06890 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluQ06890 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CluQ06890 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CluQ06890 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CluQ06890 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CluQ06890 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CluQ06890 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CluQ06890 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CluQ06890 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CluQ06890 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CluQ06890 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CluQ06890 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluQ06890 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluQ06890 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluQ06890 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluQ06890 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluQ06890 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluQ06890 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluQ06890 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CluQ06890 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluQ06890 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CluQ06890 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluQ06890 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluQ06890 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CluQ06890 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluQ06890 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluQ06890 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluQ06890 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CluQ06890 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CluQ06890 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CluQ06890 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluQ06890 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CluQ06890 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluQ06890 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CluQ06890 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluQ06890 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluQ06890 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluQ06890 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluQ06890 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluQ06890 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CluQ06890 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluQ06890 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluQ06890 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluQ06890 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluQ06890 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CluQ06890 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CluQ06890 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CluQ06890 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CluQ06890 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluQ06890 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluQ06890 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CluQ06890 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CluQ06890 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluQ06890 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CluQ06890 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CluQ06890 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluQ06890 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluQ06890 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluQ06890 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CluQ06890 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CluQ06890 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluQ06890 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms