Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Sox4Q06831 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sox4Q06831 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sox4Q06831 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sox4Q06831 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Sox4Q06831 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sox4Q06831 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sox4Q06831 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Sox4Q06831 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Sox4Q06831 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sox4Q06831 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sox4Q06831 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sox4Q06831 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox4Q06831 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox4Q06831 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Sox4Q06831 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox4Q06831 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox4Q06831 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox4Q06831 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox4Q06831 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox4Q06831 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox4Q06831 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox4Q06831 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sox4Q06831 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox4Q06831 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sox4Q06831 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sox4Q06831 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox4Q06831 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox4Q06831 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox4Q06831 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sox4Q06831 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sox4Q06831 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sox4Q06831 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox4Q06831 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox4Q06831 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox4Q06831 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox4Q06831 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sox4Q06831 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox4Q06831 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Sox4Q06831 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox4Q06831 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox4Q06831 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox4Q06831 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sox4Q06831 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox4Q06831 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sox4Q06831 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sox4Q06831 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox4Q06831 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox4Q06831 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox4Q06831 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox4Q06831 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sox4Q06831 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sox4Q06831 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox4Q06831 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox4Q06831 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox4Q06831 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox4Q06831 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox4Q06831 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox4Q06831 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox4Q06831 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox4Q06831 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sox4Q06831 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox4Q06831 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox4Q06831 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox4Q06831 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox4Q06831 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox4Q06831 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sox4Q06831 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox4Q06831 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox4Q06831 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox4Q06831 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox4Q06831 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox4Q06831 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox4Q06831 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox4Q06831 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox4Q06831 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox4Q06831 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox4Q06831 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox4Q06831 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox4Q06831 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox4Q06831 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox4Q06831 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox4Q06831 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox4Q06831 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox4Q06831 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox4Q06831 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox4Q06831 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox4Q06831 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox4Q06831 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox4Q06831 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox4Q06831 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox4Q06831 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox4Q06831 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox4Q06831 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox4Q06831 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox4Q06831 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox4Q06831 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox4Q06831 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox4Q06831 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox4Q06831 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms