Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Gjb5Q02739 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gjb5Q02739 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Gjb5Q02739 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Gjb5Q02739 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gjb5Q02739 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Gjb5Q02739 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Gjb5Q02739 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gjb5Q02739 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gjb5Q02739 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gjb5Q02739 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gjb5Q02739 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gjb5Q02739 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Gjb5Q02739 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gjb5Q02739 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gjb5Q02739 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gjb5Q02739 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Gjb5Q02739 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gjb5Q02739 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Gjb5Q02739 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gjb5Q02739 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gjb5Q02739 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gjb5Q02739 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb5Q02739 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gjb5Q02739 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gjb5Q02739 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gjb5Q02739 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gjb5Q02739 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Gjb5Q02739 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gjb5Q02739 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Gjb5Q02739 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gjb5Q02739 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gjb5Q02739 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gjb5Q02739 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gjb5Q02739 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Gjb5Q02739 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gjb5Q02739 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gjb5Q02739 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gjb5Q02739 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gjb5Q02739 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gjb5Q02739 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gjb5Q02739 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gjb5Q02739 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gjb5Q02739 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gjb5Q02739 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gjb5Q02739 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gjb5Q02739 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb5Q02739 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb5Q02739 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gjb5Q02739 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gjb5Q02739 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gjb5Q02739 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjb5Q02739 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gjb5Q02739 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gjb5Q02739 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gjb5Q02739 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gjb5Q02739 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb5Q02739 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gjb5Q02739 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gjb5Q02739 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjb5Q02739 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Gjb5Q02739 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb5Q02739 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gjb5Q02739 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gjb5Q02739 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb5Q02739 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gjb5Q02739 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gjb5Q02739 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb5Q02739 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gjb5Q02739 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb5Q02739 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb5Q02739 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gjb5Q02739 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb5Q02739 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb5Q02739 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb5Q02739 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gjb5Q02739 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb5Q02739 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjb5Q02739 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjb5Q02739 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb5Q02739 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb5Q02739 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb5Q02739 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb5Q02739 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb5Q02739 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb5Q02739 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb5Q02739 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb5Q02739 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gjb5Q02739 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb5Q02739 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb5Q02739 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gjb5Q02739 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gjb5Q02739 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gjb5Q02739 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gjb5Q02739 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms