Protein–RNA interactions for Protein: P97463

Nrtn, Neurturin, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrtnP97463 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NrtnP97463 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NrtnP97463 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NrtnP97463 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NrtnP97463 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NrtnP97463 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NrtnP97463 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NrtnP97463 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NrtnP97463 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NrtnP97463 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NrtnP97463 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NrtnP97463 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NrtnP97463 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NrtnP97463 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NrtnP97463 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NrtnP97463 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NrtnP97463 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NrtnP97463 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NrtnP97463 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NrtnP97463 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NrtnP97463 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NrtnP97463 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrtnP97463 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrtnP97463 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NrtnP97463 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NrtnP97463 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NrtnP97463 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NrtnP97463 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrtnP97463 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NrtnP97463 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NrtnP97463 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NrtnP97463 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NrtnP97463 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NrtnP97463 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NrtnP97463 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NrtnP97463 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NrtnP97463 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrtnP97463 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NrtnP97463 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NrtnP97463 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NrtnP97463 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrtnP97463 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrtnP97463 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrtnP97463 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrtnP97463 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrtnP97463 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrtnP97463 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NrtnP97463 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrtnP97463 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrtnP97463 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrtnP97463 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrtnP97463 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrtnP97463 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrtnP97463 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NrtnP97463 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrtnP97463 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrtnP97463 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NrtnP97463 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrtnP97463 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrtnP97463 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NrtnP97463 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrtnP97463 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrtnP97463 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrtnP97463 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrtnP97463 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrtnP97463 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrtnP97463 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NrtnP97463 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NrtnP97463 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NrtnP97463 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NrtnP97463 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NrtnP97463 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NrtnP97463 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NrtnP97463 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NrtnP97463 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NrtnP97463 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NrtnP97463 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NrtnP97463 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrtnP97463 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrtnP97463 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrtnP97463 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrtnP97463 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NrtnP97463 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NrtnP97463 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NrtnP97463 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NrtnP97463 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrtnP97463 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrtnP97463 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrtnP97463 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrtnP97463 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrtnP97463 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrtnP97463 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrtnP97463 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrtnP97463 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrtnP97463 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NrtnP97463 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrtnP97463 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrtnP97463 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrtnP97463 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrtnP97463 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms