Protein–RNA interactions for Protein: P70207

Plxna2, Plexin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna2P70207 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Plxna2P70207 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Plxna2P70207 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Plxna2P70207 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Plxna2P70207 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Plxna2P70207 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Plxna2P70207 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Plxna2P70207 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Plxna2P70207 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Plxna2P70207 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Plxna2P70207 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Plxna2P70207 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Plxna2P70207 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Plxna2P70207 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Plxna2P70207 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Plxna2P70207 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Plxna2P70207 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Plxna2P70207 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Plxna2P70207 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Plxna2P70207 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plxna2P70207 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plxna2P70207 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Plxna2P70207 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Plxna2P70207 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Plxna2P70207 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Plxna2P70207 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plxna2P70207 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plxna2P70207 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Plxna2P70207 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Plxna2P70207 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Plxna2P70207 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Plxna2P70207 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Plxna2P70207 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Plxna2P70207 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Plxna2P70207 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Plxna2P70207 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Plxna2P70207 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Plxna2P70207 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Plxna2P70207 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Plxna2P70207 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Plxna2P70207 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Plxna2P70207 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Plxna2P70207 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Plxna2P70207 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Plxna2P70207 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Plxna2P70207 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Plxna2P70207 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxna2P70207 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxna2P70207 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Plxna2P70207 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Plxna2P70207 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxna2P70207 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxna2P70207 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Plxna2P70207 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Plxna2P70207 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plxna2P70207 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plxna2P70207 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plxna2P70207 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plxna2P70207 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plxna2P70207 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plxna2P70207 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Plxna2P70207 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plxna2P70207 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plxna2P70207 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plxna2P70207 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Plxna2P70207 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxna2P70207 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plxna2P70207 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Plxna2P70207 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plxna2P70207 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plxna2P70207 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Plxna2P70207 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plxna2P70207 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxna2P70207 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plxna2P70207 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxna2P70207 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxna2P70207 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxna2P70207 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plxna2P70207 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plxna2P70207 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plxna2P70207 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Plxna2P70207 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plxna2P70207 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plxna2P70207 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plxna2P70207 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plxna2P70207 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plxna2P70207 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plxna2P70207 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plxna2P70207 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxna2P70207 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms