Protein–RNA interactions for Protein: P58196

Plscr4, Phospholipid scramblase 4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plscr4P58196 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plscr4P58196 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plscr4P58196 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plscr4P58196 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plscr4P58196 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plscr4P58196 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plscr4P58196 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plscr4P58196 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plscr4P58196 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plscr4P58196 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plscr4P58196 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plscr4P58196 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plscr4P58196 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Plscr4P58196 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plscr4P58196 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plscr4P58196 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plscr4P58196 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plscr4P58196 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plscr4P58196 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plscr4P58196 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plscr4P58196 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plscr4P58196 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plscr4P58196 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plscr4P58196 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plscr4P58196 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Plscr4P58196 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plscr4P58196 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plscr4P58196 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plscr4P58196 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plscr4P58196 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Plscr4P58196 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plscr4P58196 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plscr4P58196 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plscr4P58196 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plscr4P58196 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plscr4P58196 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plscr4P58196 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plscr4P58196 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plscr4P58196 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plscr4P58196 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plscr4P58196 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plscr4P58196 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plscr4P58196 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plscr4P58196 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plscr4P58196 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plscr4P58196 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plscr4P58196 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plscr4P58196 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plscr4P58196 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plscr4P58196 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plscr4P58196 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plscr4P58196 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plscr4P58196 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plscr4P58196 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plscr4P58196 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Plscr4P58196 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plscr4P58196 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plscr4P58196 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plscr4P58196 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plscr4P58196 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plscr4P58196 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plscr4P58196 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plscr4P58196 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plscr4P58196 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plscr4P58196 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plscr4P58196 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plscr4P58196 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plscr4P58196 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plscr4P58196 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plscr4P58196 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plscr4P58196 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plscr4P58196 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plscr4P58196 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plscr4P58196 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plscr4P58196 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plscr4P58196 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plscr4P58196 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plscr4P58196 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Plscr4P58196 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plscr4P58196 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plscr4P58196 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plscr4P58196 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plscr4P58196 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plscr4P58196 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms