Protein–RNA interactions for Protein: P41183

Bcl6, B-cell lymphoma 6 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl6P41183 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Bcl6P41183 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Bcl6P41183 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Bcl6P41183 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Bcl6P41183 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Bcl6P41183 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Bcl6P41183 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Bcl6P41183 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Bcl6P41183 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Bcl6P41183 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Bcl6P41183 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Bcl6P41183 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Bcl6P41183 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Bcl6P41183 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Bcl6P41183 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Bcl6P41183 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Bcl6P41183 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Bcl6P41183 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Bcl6P41183 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Bcl6P41183 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Bcl6P41183 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Bcl6P41183 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Bcl6P41183 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Bcl6P41183 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Bcl6P41183 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Bcl6P41183 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Bcl6P41183 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Bcl6P41183 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Bcl6P41183 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Bcl6P41183 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Bcl6P41183 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Bcl6P41183 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Bcl6P41183 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Bcl6P41183 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Bcl6P41183 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Bcl6P41183 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Bcl6P41183 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Bcl6P41183 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Bcl6P41183 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Bcl6P41183 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Bcl6P41183 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Bcl6P41183 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bcl6P41183 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Bcl6P41183 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Bcl6P41183 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Bcl6P41183 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl6P41183 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl6P41183 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Bcl6P41183 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Bcl6P41183 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Bcl6P41183 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bcl6P41183 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Bcl6P41183 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Bcl6P41183 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Bcl6P41183 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bcl6P41183 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl6P41183 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bcl6P41183 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl6P41183 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bcl6P41183 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bcl6P41183 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Bcl6P41183 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl6P41183 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl6P41183 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl6P41183 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl6P41183 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl6P41183 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl6P41183 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl6P41183 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl6P41183 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Bcl6P41183 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl6P41183 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl6P41183 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl6P41183 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bcl6P41183 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl6P41183 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Bcl6P41183 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bcl6P41183 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bcl6P41183 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bcl6P41183 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Bcl6P41183 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bcl6P41183 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bcl6P41183 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bcl6P41183 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Bcl6P41183 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Bcl6P41183 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl6P41183 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Bcl6P41183 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bcl6P41183 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl6P41183 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bcl6P41183 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bcl6P41183 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bcl6P41183 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bcl6P41183 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bcl6P41183 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bcl6P41183 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl6P41183 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl6P41183 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bcl6P41183 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bcl6P41183 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms