Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
FynP39688 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FynP39688 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FynP39688 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FynP39688 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FynP39688 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
FynP39688 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FynP39688 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.8■■■■□ 3
FynP39688 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.79■■■■□ 3
FynP39688 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FynP39688 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FynP39688 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FynP39688 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FynP39688 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FynP39688 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FynP39688 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FynP39688 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FynP39688 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FynP39688 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FynP39688 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FynP39688 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FynP39688 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FynP39688 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FynP39688 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FynP39688 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FynP39688 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
FynP39688 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FynP39688 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FynP39688 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FynP39688 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FynP39688 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FynP39688 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FynP39688 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FynP39688 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FynP39688 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FynP39688 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FynP39688 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FynP39688 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FynP39688 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FynP39688 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FynP39688 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FynP39688 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FynP39688 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FynP39688 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FynP39688 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FynP39688 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FynP39688 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FynP39688 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FynP39688 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FynP39688 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FynP39688 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FynP39688 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FynP39688 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FynP39688 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FynP39688 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FynP39688 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FynP39688 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FynP39688 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FynP39688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FynP39688 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FynP39688 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FynP39688 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FynP39688 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FynP39688 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FynP39688 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FynP39688 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FynP39688 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FynP39688 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FynP39688 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FynP39688 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FynP39688 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FynP39688 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FynP39688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FynP39688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FynP39688 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FynP39688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FynP39688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FynP39688 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FynP39688 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FynP39688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FynP39688 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FynP39688 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FynP39688 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FynP39688 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FynP39688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FynP39688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FynP39688 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FynP39688 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FynP39688 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FynP39688 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FynP39688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FynP39688 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FynP39688 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FynP39688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FynP39688 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FynP39688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FynP39688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FynP39688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FynP39688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FynP39688 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms