Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
HalP35492 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HalP35492 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HalP35492 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HalP35492 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
HalP35492 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HalP35492 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HalP35492 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HalP35492 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
HalP35492 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HalP35492 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HalP35492 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HalP35492 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HalP35492 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HalP35492 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HalP35492 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
HalP35492 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HalP35492 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HalP35492 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HalP35492 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HalP35492 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HalP35492 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HalP35492 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HalP35492 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HalP35492 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HalP35492 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HalP35492 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HalP35492 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HalP35492 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HalP35492 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HalP35492 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HalP35492 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HalP35492 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HalP35492 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HalP35492 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HalP35492 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HalP35492 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HalP35492 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HalP35492 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HalP35492 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HalP35492 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HalP35492 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HalP35492 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HalP35492 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HalP35492 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HalP35492 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HalP35492 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HalP35492 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HalP35492 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HalP35492 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HalP35492 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HalP35492 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HalP35492 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HalP35492 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HalP35492 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HalP35492 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HalP35492 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HalP35492 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HalP35492 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HalP35492 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HalP35492 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HalP35492 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HalP35492 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HalP35492 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HalP35492 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HalP35492 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HalP35492 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HalP35492 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HalP35492 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HalP35492 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HalP35492 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HalP35492 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HalP35492 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HalP35492 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HalP35492 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HalP35492 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HalP35492 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HalP35492 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HalP35492 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HalP35492 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HalP35492 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HalP35492 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HalP35492 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HalP35492 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HalP35492 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HalP35492 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HalP35492 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HalP35492 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HalP35492 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HalP35492 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HalP35492 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HalP35492 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HalP35492 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HalP35492 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HalP35492 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HalP35492 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HalP35492 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HalP35492 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HalP35492 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HalP35492 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms