Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
CremP27699 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CremP27699 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CremP27699 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CremP27699 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CremP27699 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CremP27699 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CremP27699 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CremP27699 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CremP27699 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CremP27699 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CremP27699 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CremP27699 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CremP27699 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CremP27699 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CremP27699 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CremP27699 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CremP27699 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CremP27699 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CremP27699 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CremP27699 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CremP27699 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CremP27699 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CremP27699 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CremP27699 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CremP27699 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CremP27699 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CremP27699 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CremP27699 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CremP27699 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CremP27699 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CremP27699 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CremP27699 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CremP27699 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CremP27699 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CremP27699 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CremP27699 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CremP27699 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CremP27699 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CremP27699 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CremP27699 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CremP27699 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CremP27699 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CremP27699 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CremP27699 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CremP27699 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CremP27699 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CremP27699 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CremP27699 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CremP27699 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CremP27699 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CremP27699 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CremP27699 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CremP27699 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CremP27699 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CremP27699 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CremP27699 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CremP27699 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CremP27699 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CremP27699 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CremP27699 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CremP27699 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CremP27699 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CremP27699 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CremP27699 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CremP27699 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CremP27699 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CremP27699 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CremP27699 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CremP27699 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CremP27699 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CremP27699 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CremP27699 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CremP27699 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CremP27699 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CremP27699 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CremP27699 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CremP27699 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CremP27699 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CremP27699 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CremP27699 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CremP27699 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CremP27699 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CremP27699 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CremP27699 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CremP27699 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CremP27699 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CremP27699 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CremP27699 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CremP27699 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CremP27699 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CremP27699 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CremP27699 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CremP27699 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CremP27699 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CremP27699 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CremP27699 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CremP27699 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CremP27699 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CremP27699 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms