Protein–RNA interactions for Protein: P22725

Wnt5a, Protein Wnt-5a, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt5aP22725 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Wnt5aP22725 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Wnt5aP22725 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Wnt5aP22725 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Wnt5aP22725 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wnt5aP22725 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Wnt5aP22725 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wnt5aP22725 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Wnt5aP22725 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Wnt5aP22725 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Wnt5aP22725 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wnt5aP22725 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Wnt5aP22725 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Wnt5aP22725 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Wnt5aP22725 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wnt5aP22725 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Wnt5aP22725 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wnt5aP22725 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wnt5aP22725 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Wnt5aP22725 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Wnt5aP22725 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wnt5aP22725 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Wnt5aP22725 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wnt5aP22725 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Wnt5aP22725 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Wnt5aP22725 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Wnt5aP22725 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wnt5aP22725 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wnt5aP22725 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wnt5aP22725 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wnt5aP22725 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wnt5aP22725 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Wnt5aP22725 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Wnt5aP22725 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wnt5aP22725 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wnt5aP22725 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wnt5aP22725 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wnt5aP22725 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Wnt5aP22725 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Wnt5aP22725 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Wnt5aP22725 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Wnt5aP22725 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wnt5aP22725 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wnt5aP22725 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wnt5aP22725 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wnt5aP22725 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wnt5aP22725 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wnt5aP22725 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wnt5aP22725 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wnt5aP22725 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wnt5aP22725 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wnt5aP22725 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wnt5aP22725 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Wnt5aP22725 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Wnt5aP22725 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wnt5aP22725 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wnt5aP22725 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wnt5aP22725 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Wnt5aP22725 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wnt5aP22725 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wnt5aP22725 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Wnt5aP22725 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Wnt5aP22725 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wnt5aP22725 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Wnt5aP22725 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wnt5aP22725 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Wnt5aP22725 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wnt5aP22725 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Wnt5aP22725 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Wnt5aP22725 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wnt5aP22725 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wnt5aP22725 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Wnt5aP22725 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Wnt5aP22725 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wnt5aP22725 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Wnt5aP22725 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Wnt5aP22725 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wnt5aP22725 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wnt5aP22725 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wnt5aP22725 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wnt5aP22725 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wnt5aP22725 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wnt5aP22725 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wnt5aP22725 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wnt5aP22725 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Wnt5aP22725 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Wnt5aP22725 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wnt5aP22725 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wnt5aP22725 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wnt5aP22725 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wnt5aP22725 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wnt5aP22725 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wnt5aP22725 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wnt5aP22725 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wnt5aP22725 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wnt5aP22725 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wnt5aP22725 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wnt5aP22725 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wnt5aP22725 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wnt5aP22725 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms