Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Itga5P11688 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Itga5P11688 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Itga5P11688 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Itga5P11688 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Itga5P11688 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itga5P11688 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Itga5P11688 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Itga5P11688 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Itga5P11688 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Itga5P11688 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Itga5P11688 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Itga5P11688 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itga5P11688 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itga5P11688 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga5P11688 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga5P11688 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Itga5P11688 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga5P11688 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itga5P11688 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga5P11688 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga5P11688 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga5P11688 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Itga5P11688 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga5P11688 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga5P11688 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga5P11688 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga5P11688 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Itga5P11688 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itga5P11688 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga5P11688 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga5P11688 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga5P11688 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga5P11688 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga5P11688 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga5P11688 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Itga5P11688 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga5P11688 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itga5P11688 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga5P11688 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga5P11688 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga5P11688 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itga5P11688 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga5P11688 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itga5P11688 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itga5P11688 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga5P11688 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga5P11688 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga5P11688 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga5P11688 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itga5P11688 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga5P11688 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga5P11688 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itga5P11688 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga5P11688 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga5P11688 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga5P11688 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga5P11688 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga5P11688 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga5P11688 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga5P11688 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga5P11688 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga5P11688 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga5P11688 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga5P11688 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga5P11688 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga5P11688 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga5P11688 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga5P11688 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga5P11688 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itga5P11688 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga5P11688 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga5P11688 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga5P11688 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga5P11688 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga5P11688 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga5P11688 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga5P11688 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga5P11688 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga5P11688 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga5P11688 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga5P11688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga5P11688 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga5P11688 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga5P11688 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga5P11688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga5P11688 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga5P11688 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itga5P11688 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga5P11688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms