Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LtaP09225 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LtaP09225 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LtaP09225 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LtaP09225 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LtaP09225 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LtaP09225 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LtaP09225 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LtaP09225 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LtaP09225 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LtaP09225 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtaP09225 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtaP09225 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LtaP09225 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LtaP09225 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LtaP09225 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LtaP09225 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LtaP09225 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LtaP09225 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LtaP09225 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LtaP09225 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtaP09225 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtaP09225 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtaP09225 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtaP09225 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtaP09225 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtaP09225 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LtaP09225 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LtaP09225 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtaP09225 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtaP09225 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LtaP09225 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtaP09225 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtaP09225 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtaP09225 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtaP09225 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtaP09225 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtaP09225 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtaP09225 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtaP09225 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtaP09225 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtaP09225 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LtaP09225 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtaP09225 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtaP09225 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtaP09225 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtaP09225 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtaP09225 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LtaP09225 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LtaP09225 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtaP09225 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LtaP09225 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtaP09225 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtaP09225 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtaP09225 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LtaP09225 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtaP09225 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LtaP09225 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtaP09225 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtaP09225 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtaP09225 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtaP09225 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtaP09225 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LtaP09225 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtaP09225 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtaP09225 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtaP09225 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LtaP09225 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtaP09225 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtaP09225 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LtaP09225 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtaP09225 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtaP09225 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtaP09225 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LtaP09225 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LtaP09225 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtaP09225 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtaP09225 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtaP09225 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtaP09225 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LtaP09225 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtaP09225 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtaP09225 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LtaP09225 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LtaP09225 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtaP09225 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtaP09225 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtaP09225 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtaP09225 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtaP09225 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtaP09225 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtaP09225 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtaP09225 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtaP09225 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtaP09225 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtaP09225 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtaP09225 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtaP09225 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtaP09225 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtaP09225 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.9 ms