Protein–RNA interactions for Protein: P04946

Ig kappa chain V-V region NQ5-89.4, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04946 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
P04946 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
P04946 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
P04946 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
P04946 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
P04946 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
P04946 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
P04946 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
P04946 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
P04946 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
P04946 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P04946 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
P04946 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
P04946 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P04946 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P04946 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
P04946 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
P04946 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P04946 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P04946 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04946 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
P04946 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
P04946 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P04946 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P04946 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P04946 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
P04946 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
P04946 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
P04946 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
P04946 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P04946 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P04946 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P04946 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P04946 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P04946 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
P04946 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
P04946 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
P04946 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P04946 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P04946 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P04946 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P04946 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P04946 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P04946 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P04946 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P04946 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P04946 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
P04946 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
P04946 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P04946 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P04946 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P04946 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
P04946 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P04946 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P04946 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P04946 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P04946 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P04946 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P04946 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P04946 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P04946 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
P04946 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P04946 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P04946 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
P04946 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P04946 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P04946 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
P04946 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
P04946 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P04946 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P04946 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P04946 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P04946 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P04946 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P04946 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P04946 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P04946 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04946 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04946 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04946 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P04946 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04946 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P04946 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04946 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04946 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04946 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04946 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P04946 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P04946 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04946 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04946 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04946 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04946 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04946 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04946 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04946 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P04946 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P04946 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04946 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04946 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms