Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
P01654 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
P01654 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P01654 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
P01654 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
P01654 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
P01654 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
P01654 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
P01654 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
P01654 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
P01654 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
P01654 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
P01654 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
P01654 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
P01654 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
P01654 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
P01654 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
P01654 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
P01654 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
P01654 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
P01654 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
P01654 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
P01654 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
P01654 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
P01654 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
P01654 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
P01654 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
P01654 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
P01654 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
P01654 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
P01654 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
P01654 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
P01654 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
P01654 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
P01654 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
P01654 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
P01654 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
P01654 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
P01654 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
P01654 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
P01654 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
P01654 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
P01654 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
P01654 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
P01654 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
P01654 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
P01654 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
P01654 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
P01654 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
P01654 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
P01654 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
P01654 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P01654 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
P01654 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
P01654 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P01654 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
P01654 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P01654 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P01654 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
P01654 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
P01654 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
P01654 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
P01654 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
P01654 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
P01654 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
P01654 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P01654 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P01654 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P01654 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
P01654 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P01654 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P01654 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P01654 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P01654 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P01654 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P01654 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
P01654 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
P01654 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
P01654 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
P01654 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01654 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01654 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P01654 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
P01654 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P01654 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P01654 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P01654 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
P01654 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
P01654 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P01654 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
P01654 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
P01654 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P01654 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
P01654 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P01654 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P01654 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
P01654 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
P01654 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01654 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
P01654 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms