Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Tcn2O88968 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tcn2O88968 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tcn2O88968 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Tcn2O88968 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Tcn2O88968 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tcn2O88968 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Tcn2O88968 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tcn2O88968 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tcn2O88968 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tcn2O88968 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tcn2O88968 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Tcn2O88968 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tcn2O88968 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tcn2O88968 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tcn2O88968 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tcn2O88968 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tcn2O88968 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Tcn2O88968 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tcn2O88968 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tcn2O88968 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tcn2O88968 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tcn2O88968 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tcn2O88968 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcn2O88968 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcn2O88968 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcn2O88968 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcn2O88968 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcn2O88968 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcn2O88968 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tcn2O88968 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tcn2O88968 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tcn2O88968 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tcn2O88968 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcn2O88968 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tcn2O88968 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcn2O88968 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcn2O88968 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcn2O88968 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcn2O88968 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcn2O88968 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcn2O88968 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcn2O88968 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcn2O88968 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcn2O88968 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcn2O88968 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcn2O88968 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcn2O88968 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcn2O88968 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tcn2O88968 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcn2O88968 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tcn2O88968 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcn2O88968 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcn2O88968 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcn2O88968 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcn2O88968 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcn2O88968 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcn2O88968 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcn2O88968 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcn2O88968 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tcn2O88968 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcn2O88968 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcn2O88968 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tcn2O88968 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcn2O88968 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tcn2O88968 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcn2O88968 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tcn2O88968 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcn2O88968 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcn2O88968 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tcn2O88968 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcn2O88968 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcn2O88968 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcn2O88968 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tcn2O88968 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcn2O88968 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcn2O88968 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcn2O88968 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcn2O88968 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tcn2O88968 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tcn2O88968 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcn2O88968 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcn2O88968 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tcn2O88968 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcn2O88968 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms