Protein–RNA interactions for Protein: O55183

Stc1, Stanniocalcin-1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stc1O55183 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Stc1O55183 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Stc1O55183 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Stc1O55183 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Stc1O55183 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Stc1O55183 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Stc1O55183 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Stc1O55183 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Stc1O55183 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Stc1O55183 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Stc1O55183 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Stc1O55183 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Stc1O55183 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Stc1O55183 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Stc1O55183 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Stc1O55183 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Stc1O55183 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Stc1O55183 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Stc1O55183 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Stc1O55183 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Stc1O55183 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Stc1O55183 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Stc1O55183 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Stc1O55183 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Stc1O55183 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Stc1O55183 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Stc1O55183 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Stc1O55183 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Stc1O55183 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Stc1O55183 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Stc1O55183 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Stc1O55183 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Stc1O55183 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stc1O55183 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Stc1O55183 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Stc1O55183 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Stc1O55183 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Stc1O55183 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stc1O55183 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stc1O55183 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stc1O55183 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stc1O55183 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Stc1O55183 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stc1O55183 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stc1O55183 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stc1O55183 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stc1O55183 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stc1O55183 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stc1O55183 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stc1O55183 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stc1O55183 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stc1O55183 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stc1O55183 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stc1O55183 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Stc1O55183 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stc1O55183 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stc1O55183 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Stc1O55183 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stc1O55183 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stc1O55183 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Stc1O55183 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stc1O55183 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stc1O55183 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stc1O55183 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stc1O55183 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stc1O55183 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stc1O55183 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stc1O55183 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stc1O55183 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stc1O55183 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stc1O55183 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stc1O55183 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Stc1O55183 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stc1O55183 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stc1O55183 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stc1O55183 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Stc1O55183 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stc1O55183 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stc1O55183 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Stc1O55183 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stc1O55183 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Stc1O55183 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stc1O55183 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stc1O55183 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stc1O55183 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stc1O55183 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stc1O55183 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Stc1O55183 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stc1O55183 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stc1O55183 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stc1O55183 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stc1O55183 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stc1O55183 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stc1O55183 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stc1O55183 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stc1O55183 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stc1O55183 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stc1O55183 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stc1O55183 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stc1O55183 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms