Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Atf6bO35451 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf6bO35451 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf6bO35451 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atf6bO35451 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf6bO35451 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf6bO35451 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf6bO35451 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atf6bO35451 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atf6bO35451 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf6bO35451 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf6bO35451 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf6bO35451 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf6bO35451 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf6bO35451 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf6bO35451 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf6bO35451 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf6bO35451 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf6bO35451 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf6bO35451 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf6bO35451 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf6bO35451 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf6bO35451 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf6bO35451 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf6bO35451 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf6bO35451 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf6bO35451 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf6bO35451 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf6bO35451 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf6bO35451 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf6bO35451 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf6bO35451 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf6bO35451 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf6bO35451 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf6bO35451 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf6bO35451 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf6bO35451 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf6bO35451 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf6bO35451 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf6bO35451 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf6bO35451 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf6bO35451 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf6bO35451 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf6bO35451 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf6bO35451 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf6bO35451 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf6bO35451 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf6bO35451 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf6bO35451 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf6bO35451 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf6bO35451 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf6bO35451 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf6bO35451 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf6bO35451 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf6bO35451 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf6bO35451 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf6bO35451 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf6bO35451 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf6bO35451 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf6bO35451 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf6bO35451 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf6bO35451 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf6bO35451 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf6bO35451 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf6bO35451 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf6bO35451 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf6bO35451 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf6bO35451 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf6bO35451 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf6bO35451 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6bO35451 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6bO35451 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf6bO35451 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf6bO35451 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf6bO35451 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf6bO35451 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf6bO35451 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf6bO35451 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf6bO35451 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf6bO35451 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf6bO35451 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf6bO35451 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf6bO35451 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf6bO35451 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf6bO35451 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf6bO35451 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf6bO35451 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf6bO35451 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf6bO35451 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf6bO35451 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf6bO35451 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf6bO35451 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf6bO35451 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf6bO35451 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf6bO35451 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms