Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ubap1lG3UW59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ubap1lG3UW59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubap1lG3UW59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubap1lG3UW59 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ubap1lG3UW59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ubap1lG3UW59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ubap1lG3UW59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ubap1lG3UW59 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ubap1lG3UW59 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ubap1lG3UW59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ubap1lG3UW59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ubap1lG3UW59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubap1lG3UW59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ubap1lG3UW59 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ubap1lG3UW59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ubap1lG3UW59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ubap1lG3UW59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ubap1lG3UW59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ubap1lG3UW59 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ubap1lG3UW59 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ubap1lG3UW59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ubap1lG3UW59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ubap1lG3UW59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ubap1lG3UW59 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubap1lG3UW59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ubap1lG3UW59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubap1lG3UW59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubap1lG3UW59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ubap1lG3UW59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubap1lG3UW59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ubap1lG3UW59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ubap1lG3UW59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ubap1lG3UW59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubap1lG3UW59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubap1lG3UW59 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubap1lG3UW59 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubap1lG3UW59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubap1lG3UW59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ubap1lG3UW59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubap1lG3UW59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubap1lG3UW59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ubap1lG3UW59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ubap1lG3UW59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Ubap1lG3UW59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ubap1lG3UW59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ubap1lG3UW59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ubap1lG3UW59 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Ubap1lG3UW59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ubap1lG3UW59 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ubap1lG3UW59 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubap1lG3UW59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ubap1lG3UW59 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubap1lG3UW59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ubap1lG3UW59 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ubap1lG3UW59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ubap1lG3UW59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ubap1lG3UW59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ubap1lG3UW59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ubap1lG3UW59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Ubap1lG3UW59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ubap1lG3UW59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ubap1lG3UW59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ubap1lG3UW59 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ubap1lG3UW59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ubap1lG3UW59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ubap1lG3UW59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ubap1lG3UW59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ubap1lG3UW59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ubap1lG3UW59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ubap1lG3UW59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ubap1lG3UW59 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms