Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Samd1D3YXK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Samd1D3YXK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Samd1D3YXK1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Samd1D3YXK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Samd1D3YXK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Samd1D3YXK1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Samd1D3YXK1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Samd1D3YXK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Samd1D3YXK1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Samd1D3YXK1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Samd1D3YXK1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Samd1D3YXK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Samd1D3YXK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Samd1D3YXK1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Samd1D3YXK1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Samd1D3YXK1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Samd1D3YXK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Samd1D3YXK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Samd1D3YXK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Samd1D3YXK1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Samd1D3YXK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Samd1D3YXK1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Samd1D3YXK1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Samd1D3YXK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Samd1D3YXK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Samd1D3YXK1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Samd1D3YXK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Samd1D3YXK1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Samd1D3YXK1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Samd1D3YXK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Samd1D3YXK1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Samd1D3YXK1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Samd1D3YXK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Samd1D3YXK1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Samd1D3YXK1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Samd1D3YXK1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Samd1D3YXK1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Samd1D3YXK1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Samd1D3YXK1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Samd1D3YXK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Samd1D3YXK1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Samd1D3YXK1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Samd1D3YXK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Samd1D3YXK1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Samd1D3YXK1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Samd1D3YXK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Samd1D3YXK1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Samd1D3YXK1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Samd1D3YXK1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Samd1D3YXK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Samd1D3YXK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Samd1D3YXK1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Samd1D3YXK1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Samd1D3YXK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Samd1D3YXK1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Samd1D3YXK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Samd1D3YXK1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Samd1D3YXK1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samd1D3YXK1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Samd1D3YXK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Samd1D3YXK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Samd1D3YXK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Samd1D3YXK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Samd1D3YXK1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Samd1D3YXK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Samd1D3YXK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Samd1D3YXK1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Samd1D3YXK1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Samd1D3YXK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Samd1D3YXK1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Samd1D3YXK1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Samd1D3YXK1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Samd1D3YXK1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Samd1D3YXK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms