Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Ssc4dA1L0T3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ssc4dA1L0T3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ssc4dA1L0T3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssc4dA1L0T3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ssc4dA1L0T3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ssc4dA1L0T3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ssc4dA1L0T3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssc4dA1L0T3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ssc4dA1L0T3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ssc4dA1L0T3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ssc4dA1L0T3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ssc4dA1L0T3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ssc4dA1L0T3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ssc4dA1L0T3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ssc4dA1L0T3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ssc4dA1L0T3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Ssc4dA1L0T3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ssc4dA1L0T3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ssc4dA1L0T3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ssc4dA1L0T3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ssc4dA1L0T3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ssc4dA1L0T3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ssc4dA1L0T3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ssc4dA1L0T3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ssc4dA1L0T3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Ssc4dA1L0T3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ssc4dA1L0T3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Ssc4dA1L0T3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ssc4dA1L0T3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ssc4dA1L0T3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ssc4dA1L0T3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ssc4dA1L0T3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ssc4dA1L0T3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ssc4dA1L0T3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ssc4dA1L0T3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ssc4dA1L0T3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ssc4dA1L0T3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ssc4dA1L0T3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ssc4dA1L0T3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ssc4dA1L0T3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ssc4dA1L0T3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ssc4dA1L0T3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssc4dA1L0T3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssc4dA1L0T3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssc4dA1L0T3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssc4dA1L0T3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssc4dA1L0T3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssc4dA1L0T3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ssc4dA1L0T3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ssc4dA1L0T3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ssc4dA1L0T3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ssc4dA1L0T3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssc4dA1L0T3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssc4dA1L0T3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssc4dA1L0T3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssc4dA1L0T3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssc4dA1L0T3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssc4dA1L0T3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssc4dA1L0T3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ssc4dA1L0T3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ssc4dA1L0T3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ssc4dA1L0T3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ssc4dA1L0T3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ssc4dA1L0T3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ssc4dA1L0T3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssc4dA1L0T3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssc4dA1L0T3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssc4dA1L0T3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssc4dA1L0T3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssc4dA1L0T3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssc4dA1L0T3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssc4dA1L0T3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssc4dA1L0T3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ssc4dA1L0T3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssc4dA1L0T3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssc4dA1L0T3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssc4dA1L0T3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ssc4dA1L0T3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssc4dA1L0T3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssc4dA1L0T3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssc4dA1L0T3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssc4dA1L0T3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssc4dA1L0T3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ssc4dA1L0T3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ssc4dA1L0T3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ssc4dA1L0T3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssc4dA1L0T3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ssc4dA1L0T3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ssc4dA1L0T3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ssc4dA1L0T3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ssc4dA1L0T3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssc4dA1L0T3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssc4dA1L0T3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssc4dA1L0T3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssc4dA1L0T3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ssc4dA1L0T3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssc4dA1L0T3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms