Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 446.8 ms