Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.78
HERC1Q15751 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
HERC1Q15751 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HERC1Q15751 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HERC1Q15751 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HERC1Q15751 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HERC1Q15751 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HERC1Q15751 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HERC1Q15751 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HERC1Q15751 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HERC1Q15751 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
HERC1Q15751 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HERC1Q15751 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
HERC1Q15751 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HERC1Q15751 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HERC1Q15751 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HERC1Q15751 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HERC1Q15751 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HERC1Q15751 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms