Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
HERC1Q15751 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HERC1Q15751 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HERC1Q15751 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
HERC1Q15751 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HERC1Q15751 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HERC1Q15751 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms