Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-6.19□□□□□ -3.4
CENPEQ02224 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-6.19□□□□□ -3.4
CENPEQ02224 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-6.19□□□□□ -3.4
CENPEQ02224 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-6.24□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
CENPEQ02224 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
CENPEQ02224 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-6.34□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-6.37□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.43
CENPEQ02224 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-6.42□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-6.43□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-6.44□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-6.44□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-6.45□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.44
CENPEQ02224 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-6.48□□□□□ -3.45
CENPEQ02224 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-6.48□□□□□ -3.45
CENPEQ02224 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-6.49□□□□□ -3.45
CENPEQ02224 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
CENPEQ02224 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-6.55□□□□□ -3.46
CENPEQ02224 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
CENPEQ02224 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-6.57□□□□□ -3.46
CENPEQ02224 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-6.64□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
CENPEQ02224 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-6.7□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-6.7□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-6.7□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
CENPEQ02224 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-6.75□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-6.75□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-6.77□□□□□ -3.49
CENPEQ02224 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
CENPEQ02224 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-6.85□□□□□ -3.51
CENPEQ02224 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-6.85□□□□□ -3.51
CENPEQ02224 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-6.88□□□□□ -3.51
CENPEQ02224 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-6.89□□□□□ -3.51
CENPEQ02224 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-6.97□□□□□ -3.52
CENPEQ02224 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
CENPEQ02224 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
CENPEQ02224 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-7□□□□□ -3.53
CENPEQ02224 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
CENPEQ02224 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-7.06□□□□□ -3.54
CENPEQ02224 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-7.07□□□□□ -3.54
CENPEQ02224 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-7.07□□□□□ -3.54
CENPEQ02224 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
CENPEQ02224 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
CENPEQ02224 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
CENPEQ02224 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
CENPEQ02224 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-7.29□□□□□ -3.58
CENPEQ02224 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-7.3□□□□□ -3.58
CENPEQ02224 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-7.32□□□□□ -3.58
CENPEQ02224 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-7.33□□□□□ -3.58
CENPEQ02224 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-7.33□□□□□ -3.58
CENPEQ02224 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
CENPEQ02224 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
CENPEQ02224 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-7.44□□□□□ -3.6
CENPEQ02224 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
CENPEQ02224 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-7.48□□□□□ -3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms