Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
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SGCEO43556 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SGCEO43556 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
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SGCEO43556 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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SGCEO43556 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
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SGCEO43556 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SGCEO43556 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
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SGCEO43556 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
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SGCEO43556 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
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SGCEO43556 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
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SGCEO43556 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SGCEO43556 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SGCEO43556 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SGCEO43556 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SGCEO43556 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
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SGCEO43556 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SGCEO43556 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SGCEO43556 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
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SGCEO43556 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
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SGCEO43556 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
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SGCEO43556 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SGCEO43556 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SGCEO43556 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SGCEO43556 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SGCEO43556 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SGCEO43556 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SGCEO43556 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
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