Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SMG1Q96Q15 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.2□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMG1Q96Q15 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SMG1Q96Q15 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.31□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SMG1Q96Q15 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
SMG1Q96Q15 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
SMG1Q96Q15 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SMG1Q96Q15 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.14
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