Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.94□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VSTM4Q8IW00 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
VSTM4Q8IW00 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VSTM4Q8IW00 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
VSTM4Q8IW00 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VSTM4Q8IW00 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms