Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RRS1Q15050 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RRS1Q15050 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RRS1Q15050 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RRS1Q15050 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RRS1Q15050 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RRS1Q15050 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RRS1Q15050 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RRS1Q15050 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RRS1Q15050 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RRS1Q15050 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RRS1Q15050 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RRS1Q15050 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms