Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOFQ13790 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOFQ13790 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOFQ13790 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOFQ13790 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOFQ13790 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOFQ13790 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOFQ13790 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOFQ13790 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOFQ13790 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOFQ13790 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOFQ13790 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOFQ13790 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOFQ13790 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOFQ13790 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOFQ13790 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOFQ13790 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOFQ13790 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
APOFQ13790 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
APOFQ13790 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
APOFQ13790 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
APOFQ13790 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
APOFQ13790 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
APOFQ13790 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
APOFQ13790 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
APOFQ13790 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
APOFQ13790 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
APOFQ13790 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
APOFQ13790 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
APOFQ13790 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
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APOFQ13790 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
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APOFQ13790 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
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APOFQ13790 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
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APOFQ13790 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
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APOFQ13790 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
APOFQ13790 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
APOFQ13790 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
APOFQ13790 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
APOFQ13790 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
APOFQ13790 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
APOFQ13790 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
APOFQ13790 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
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