Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
PRDM2Q13029 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
PRDM2Q13029 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
PRDM2Q13029 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
PRDM2Q13029 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
PRDM2Q13029 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PRDM2Q13029 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.35□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
PRDM2Q13029 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
PRDM2Q13029 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
PRDM2Q13029 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
PRDM2Q13029 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
PRDM2Q13029 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
PRDM2Q13029 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
PRDM2Q13029 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
PRDM2Q13029 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
PRDM2Q13029 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.16
PRDM2Q13029 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
PRDM2Q13029 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
PRDM2Q13029 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms