Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CLDN8P56748 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CLDN8P56748 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CLDN8P56748 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CLDN8P56748 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CLDN8P56748 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CLDN8P56748 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CLDN8P56748 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CLDN8P56748 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CLDN8P56748 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CLDN8P56748 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CLDN8P56748 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CLDN8P56748 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CLDN8P56748 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CLDN8P56748 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CLDN8P56748 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CLDN8P56748 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CLDN8P56748 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CLDN8P56748 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CLDN8P56748 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
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CLDN8P56748 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.89□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CLDN8P56748 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
CLDN8P56748 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.03□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CLDN8P56748 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CLDN8P56748 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CLDN8P56748 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
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