Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NESP48681 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NESP48681 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NESP48681 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
NESP48681 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
NESP48681 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NESP48681 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NESP48681 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NESP48681 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NESP48681 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NESP48681 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
NESP48681 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NESP48681 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
NESP48681 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
NESP48681 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
NESP48681 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
NESP48681 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
NESP48681 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
NESP48681 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NESP48681 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NESP48681 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
NESP48681 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
NESP48681 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
NESP48681 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
NESP48681 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
NESP48681 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
NESP48681 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
NESP48681 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
NESP48681 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
NESP48681 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
NESP48681 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
NESP48681 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
NESP48681 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
NESP48681 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
NESP48681 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-5.66□□□□□ -3.32
NESP48681 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-5.66□□□□□ -3.32
NESP48681 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
NESP48681 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
NESP48681 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
NESP48681 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
NESP48681 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
NESP48681 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
NESP48681 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
NESP48681 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
NESP48681 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
NESP48681 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
NESP48681 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
NESP48681 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
NESP48681 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
NESP48681 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
NESP48681 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
NESP48681 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
NESP48681 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
NESP48681 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
NESP48681 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
NESP48681 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-5.8□□□□□ -3.34
NESP48681 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
NESP48681 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
NESP48681 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
NESP48681 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
NESP48681 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
NESP48681 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
NESP48681 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
NESP48681 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
NESP48681 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
NESP48681 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
NESP48681 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
NESP48681 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
NESP48681 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
NESP48681 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
NESP48681 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
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NESP48681 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
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NESP48681 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
NESP48681 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NESP48681 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-5.92□□□□□ -3.36
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NESP48681 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
NESP48681 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
NESP48681 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NESP48681 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NESP48681 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NESP48681 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
NESP48681 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
NESP48681 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NESP48681 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
NESP48681 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
NESP48681 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
NESP48681 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
NESP48681 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
NESP48681 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
NESP48681 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
NESP48681 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
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