Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232 ms