Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRIM63Q969Q1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRIM63Q969Q1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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