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Protein–RNA interactions for Protein: Q16385
SSX2, Protein SSX2, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSX2
Q16385
RNU6-844P-201
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102 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
RNU6-22P-201
ENST00000384355
107 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-3.14
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
98 nt
BASIC
-3.14
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
-3.14
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
RNU6-315P-201
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107 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
SSX2
Q16385
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-1154P-201
ENST00000391001
104 nt
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-1094P-201
ENST00000362416
104 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-1117P-201
ENST00000384525
104 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
TMSB4XP3-201
ENST00000445144
114 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-3.18
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
Y_RNA.17-201
ENST00000362433
111 nt
BASIC
-3.19
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-3.19
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-1241P-201
ENST00000384536
107 nt
BASIC
-3.19
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-895P-201
ENST00000384125
103 nt
BASIC
-3.2
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
-3.2
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-1134P-201
ENST00000365156
101 nt
BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
MIR154-201
ENST00000385243
84 nt
BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
RNU6-313P-201
ENST00000516317
112 nt
BASIC
-3.22
□□□□□ -2.92
SSX2
Q16385
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-32P-201
ENST00000383948
107 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-13P-201
ENST00000384248
107 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-12P-201
ENST00000384604
107 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-41P-201
ENST00000384741
107 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
snosnR66.1-201
ENST00000391095
99 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
Y_RNA.73-201
ENST00000362910
113 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
SNORD116-24-201
ENST00000384549
92 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-520P-201
ENST00000384717
104 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-70P-201
ENST00000516438
60 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-789P-201
ENST00000517105
102 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
Y_RNA.316-201
ENST00000365118
111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-3.25
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
-3.26
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-3.27
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
Y_RNA.313-201
ENST00000365095
103 nt
BASIC
-3.28
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
RNU6-649P-201
ENST00000384463
107 nt
BASIC
-3.28
□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
MIR581-201
ENST00000384895
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.93
SSX2
Q16385
MIR5588-201
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BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
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BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.640-201
ENST00000459296
112 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.803-201
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112 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.815-201
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112 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.795-201
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112 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.827-201
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112 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
RNU7-160P-201
ENST00000516660
62 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-3.33
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-3.33
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
RNU6-828P-201
ENST00000364876
107 nt
BASIC
-3.34
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
MIR548N-201
ENST00000408742
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-3.34
□□□□□ -2.94
SSX2
Q16385
Y_RNA.349-201
ENST00000365406
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
RNU6-147P-201
ENST00000383983
107 nt
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR4712-201
ENST00000583750
82 nt
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
SNORA17.4-201
ENST00000391287
132 nt
BASIC
-3.37
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
RNY4P9-201
ENST00000363194
97 nt
BASIC
-3.38
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR548M-201
ENST00000408260
86 nt
BASIC
-3.38
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR7110-201
ENST00000612638
86 nt
BASIC
-3.38
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
RNU6-1131P-201
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107 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR548AI-201
ENST00000579940
88 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR3668-201
ENST00000582138
75 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
MIR1245B-201
ENST00000636115
69 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
SSX2
Q16385
RNU6-810P-201
ENST00000364001
107 nt
BASIC
-3.41
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
Y_RNA.186-201
ENST00000363899
92 nt
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-49P-201
ENST00000384256
107 nt
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU7-171P-201
ENST00000459581
62 nt
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
Y_RNA.788-201
ENST00000622394
112 nt
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
SNORD60.1-201
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73 nt
BASIC
-3.44
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-361P-201
ENST00000364454
107 nt
BASIC
-3.44
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
Y_RNA.291-201
ENST00000364886
113 nt
BASIC
-3.44
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-3.44
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-1324P-201
ENST00000384222
107 nt
BASIC
-3.46
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
SNORD116.2-201
ENST00000391251
93 nt
BASIC
-3.46
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-1191P-201
ENST00000516799
107 nt
BASIC
-3.46
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
Y_RNA.629-201
ENST00000411368
105 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-231P-201
ENST00000517122
103 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
SSX2
Q16385
RNU6-530P-201
ENST00000391180
107 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
RNU6-1206P-201
ENST00000516339
103 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
SNORD113-3-201
ENST00000364830
72 nt
BASIC
-3.49
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
ZEB2_AS1_4.1-201
ENST00000615159
78 nt
BASIC
-3.49
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
MIR379-201
ENST00000362218
67 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
SSX2
Q16385
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
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