Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
USF2Q15853 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
USF2Q15853 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
USF2Q15853 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
USF2Q15853 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
USF2Q15853 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
USF2Q15853 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
USF2Q15853 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
USF2Q15853 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
USF2Q15853 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USF2Q15853 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USF2Q15853 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USF2Q15853 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USF2Q15853 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USF2Q15853 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
USF2Q15853 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
USF2Q15853 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
USF2Q15853 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
USF2Q15853 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
USF2Q15853 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
USF2Q15853 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
USF2Q15853 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
USF2Q15853 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
USF2Q15853 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
USF2Q15853 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
USF2Q15853 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
USF2Q15853 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
USF2Q15853 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
USF2Q15853 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
USF2Q15853 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
USF2Q15853 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USF2Q15853 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USF2Q15853 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USF2Q15853 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.82□□□□□ -2.86
USF2Q15853 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USF2Q15853 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USF2Q15853 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USF2Q15853 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USF2Q15853 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USF2Q15853 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USF2Q15853 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USF2Q15853 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USF2Q15853 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USF2Q15853 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USF2Q15853 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USF2Q15853 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
USF2Q15853 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
USF2Q15853 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms