Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.33□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SYCP1Q15431 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SYCP1Q15431 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.44□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SYCP1Q15431 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SYCP1Q15431 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SYCP1Q15431 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.62□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SYCP1Q15431 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SYCP1Q15431 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.8 ms