Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNPS1Q15287 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNPS1Q15287 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
RNPS1Q15287 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RNPS1Q15287 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RNPS1Q15287 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms