Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SHROOM2Q13796 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SHROOM2Q13796 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SHROOM2Q13796 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
SHROOM2Q13796 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SHROOM2Q13796 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
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SHROOM2Q13796 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.54□□□□□ -3.14
SHROOM2Q13796 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
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SHROOM2Q13796 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SHROOM2Q13796 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
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SHROOM2Q13796 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
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SHROOM2Q13796 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
SHROOM2Q13796 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SHROOM2Q13796 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
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SHROOM2Q13796 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
SHROOM2Q13796 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
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SHROOM2Q13796 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
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SHROOM2Q13796 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SHROOM2Q13796 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SHROOM2Q13796 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
SHROOM2Q13796 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
SHROOM2Q13796 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
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