Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.16
CPSF1Q10570 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.75□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
CPSF1Q10570 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
CPSF1Q10570 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.91□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
CPSF1Q10570 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CPSF1Q10570 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.07□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
CPSF1Q10570 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
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