Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
CASQ1P31415 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CASQ1P31415 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
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CASQ1P31415 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.29□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
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CASQ1P31415 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CASQ1P31415 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CASQ1P31415 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CASQ1P31415 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
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CASQ1P31415 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
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CASQ1P31415 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
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CASQ1P31415 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CASQ1P31415 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CASQ1P31415 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CASQ1P31415 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CASQ1P31415 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.46□□□□□ -2.96
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CASQ1P31415 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
CASQ1P31415 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CASQ1P31415 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CASQ1P31415 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CASQ1P31415 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CASQ1P31415 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CASQ1P31415 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
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